Kinh nghiệm khi chuẩn bị cho một đợt thanh tra thuế: Tìm hiểu cùng chuyên gia
Khi công ty bạn nhận được thông báo thanh tra thuế thì các bạn cần làm gì và chuẩn bị những hồ sơ gì; Việc rà soát lại sổ sách kế toán, chứng từ, báo cóa tài chính là một trong những vấn đề TRỌNG YẾU mà bạn cần phải thực hiện và điều chỉnh ngay cho doanh nghiệp dựa trên các quy định về thuế có giá trị hiệu lực hiện hành.
Bài viết này các chuyên gia chúng tôi sẽ tổng hợp lại những kinh nghiệm trong hơn 15 năm qua nhằm mục đích chia sẻ để doanh nghiệp luôn tuân thủ các quy định của luật kế toán và thuế mới nhất, áp dụng vào doanh nghiệp chính xác, hạn chế tối đã các rủi ro tiềm tàng.

Kinh nghiệm khi chuẩn bị cho một đợt thanh tra thuế
Cùng các kiểm toán viên hành nghề của thương hiệu dichvukiemtoanbctc.com tìm hiểu chi tiết nhất các bạn nhé.
Những công ty nào thường sẽ bị thanh tra thuế? Quyết toán thuế?
Thanh, kiểm tra thuế năm 2025, có các trường hợp doanh nghiệp sẽ được tập trung để thanh, kiểm tra thuế, gồm:
– Doanh nghiệp chuyển giá.
– Doanh nghiệp phát sinh lỗ lũy kế nhiều năm.
– Doanh nghiệp được hưởng ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp, thuế GTGT .. Và các loại thuế phí khác theo quy định của pháp luật.
– Doanh nghiệp có các khoản chi trả cho tập đoàn.
– Doanh nghiệp trong lĩnh vực thương mại điện tử.
– Doanh nghiệp được hoàn thuế giá trị gia tăng … Và nhiều trường hợp khác có rủi ro về thuế cần được ưu tiên kiểm tra đầu tiên.
Trên thực tế thì không phải 5 hay 7 hay 10 năm công ty sẽ bị kiểm tra thuế, vấn đề kiểm tra thuế bởi Cơ quan thuế hay các anh chị kiểm toán nhà nước còn tùy thuộc vào nhiều yếu tố như: doanh nghiệp có rủi ro gì không, vì sao lỗ lũy kế liên tục nhiều năm … Và nhiều yếu tố khác nha các bạn.
>>> Xem thêm: Cần chuẩn bị những gì khi thanh tra thuế: tìm hiểu cùng chuyên gia kiểm toán viên hành nghề Việt Nam.
Chi tiết các rủi ro về thuế mà công ty thường gặp khi quyết toán thuế là gì?
Về lệ phí môn bài?
Các bạn rà soát lại xem công ty có đang nộp tờ khai lệ phí môn bài đúng theo quy định hay không, hạch toán kế toán có đúng hay không. Các bạn có thể tham khảo chi tiết:
Về thuế giá trị gia tăng
Các bạn cần đối chiếu thuế GTGT đầu vào – đầu ra giữa sổ sách kế toán, báo cáo tài chính với tờ khai thuế giá trị gia tăng đã đúng chưa.
Thuế giá trị gia tăng đầu vào có đủ điều kiện khấu trừ thuế tại công ty hay không.
Các bút toán hạch toán TK 133 có hợp lý hay không, nếu không thì chúng ta tiến hành điều chỉnh lại sổ sách kế toán, điều chỉnh tờ khai thuế GTGT để nộp lại theo đúng quy định của luật thuế GTGT mới nhất hiện nay.
Về Thuế thu nhập doanh nghiệp
Kiểm tra xem các chi phí có hợp lý hợp lệ không, có đủ điều kiện ghi nhận chi phí khi tính thuế thu nhập doanh nghiệp không.
Kiểm tra tờ khai quyết toán thuế thu nhập doanh nghiệp đã đúng chưa và nếu chưa đúng thì tiến hành điều chỉnh và nộp lại.
Về thuế thu nhập cá nhân
Kiểm tra đối chiếu bảng lương và các chứng từ liên quan xem đã hạch toán vào chi phí trên sổ nhật ký chung, sổ cái TK 334 đã hợp lý theo đúng quy định chưa.
Xem quyết toán thuế TNCN đã đúng chưa.
Các rủi ro cần được kiểm soát trong thanh tra thuế mà kế toán thuế và chủ doanh nghiệp cần nắm chi tiết?
Trước khi trả lời cho câu hỏi cần chuẩn bị gì cho cuộc thanh tra thuế, các doanh nghiệp cần biết trước về một số rủi ro dễ gặp trong các kỳ thanh tra thuế để lưu ý và kiểm soát, gồm:
1 Rủi ro về mặt kỹ thuật
Đây là các rủi ro liên quan đến các quy định thuế – kế toán mà doanh nghiệp chưa kịp cập nhật hoặc chưa hiểu, hiểu nhầm, áp dụng sai; rủi ro xuất phát từ đặc thù hoạt động của doanh nghiệp; từ thẩm quyền thanh tra – kiểm tra thuế; từ quy trình thủ tục thanh tra; từ quy trình thủ tục khiếu kiện – khiếu nại;
2 Rủi ro phi kỹ thuật
Đây là các rủi ro liên quan đến nhân sự phụ trách; phương pháp phối hợp làm việc giữa các bên; cách tiếp cận với từng vấn đề hoặc cơ quan; phương pháp giao tiếp, trao đổi với cơ quan thuế.
Doanh nghiệp cần chuẩn bị gì cho cuộc thanh tra thuế?
1 Trước khi cuộc thanh, kiểm tra thuế diễn ra
Rà soát lại toàn bộ hồ sơ thuế
Lưu ý các khía cạnh pháp lý, giấy phép liên quan đến các hoạt động của doanh nghiệp
Kê khai điều chỉnh (nếu có) trước khi cuộc thanh, kiểm tra thuế diễn ra
Cập nhật thông tin về lý do và chủ đề mà cơ quan thuế sẽ kiểm tra
Sắp xếp thời gian để chuẩn bị đầy đủ trước khi thanh, kiểm tra thuế
Thông báo tới các bộ phận có liên quan của doanh nghiệp
Cân nhắc về việc mới các chuyên gia tư vấn thuế tham gia.
2 Trong thời gian diễn ra thanh, kiểm tra thuế
Chỉ định nhân viên đủ kinh nghiệm làm việc với đoàn thanh, kiểm tra thuế
Giữ bình tĩnh giải trình các vấn đề
Tránh đối đầu, cố gắng giải quyết để thông qua đối thoại
Cân nhắc thương lượng và chấp nhận giải pháp có lợi cho cả hai bên
Tham vấn ý kiến của ban lãnh đạo công ty hoặc đơn vị tư vấn hoặc cả hai
Thảo luận trước với cán bộ thuế về việc có thể khiếu nại kết quả thanh kiểm tra thuế.
3 Sau khi kết thúc thanh, kiểm tra thuế
Rà soát kỹ lưỡng các “biên bản” và cân nhắc tham khảo ý kiến chuyên gia tư vấn thuế
Quyết định những điều chỉnh nào có thể chấp nhận hoặc không chấp nhận
Chuẩn bị ý kiến để đưa vào biên bản và ký biên bản đúng hạn, nộp đơn xin gia hạn
Nếu vẫn còn vấn đề tranh chấp, cân nhắc đưa ý kiến bảo lưu trong biên bản
Cân nhắc xin hướng dẫn từ Tổng cục Thuế/Bộ Tài chính
Khi đã có quyết định của cơ quan thuế, nên nộp tiền thuế truy thu, các khoản phạt trong khi tiến hành thủ tục khiếu nại để tránh lãi phạt chậm nộp
Nộp đơn khiếu nại đúng thời hạn (trong vòng 90 ngày cho khiếu nại lần đầu và 30 ngày cho khiếu nại lần 2).
Các quy định doanh nghiệp cần biết liên quan đến thanh, kiểm tra thuế
Thời hiệu xử lý vi phạm về thuế và chậm nộp thuế
| Hành vi vi phạm | Thời hiệu xử phạt |
| Hóa đơn |
|
| Thủ tục thuế | 02 năm (kể từ ngày kế tiếp ngày kết thúc thời hạn phải thực hiện thủ tục thuế theo quy định đến ngày ra quyết định xử phạt) |
| Khai sai, trốn thuế | 05 năm kể từ ngày tiếp theo ngày cuối cùng của thời hạn nộp hồ sơ khai thuế đến ngày ra quyết định xử phạt |
| Chậm nộp | 10 năm trở về trước, kể từ ngày phát hiện hành vi vi phạm |
| Cơ quan tiến hành tố tụng hình sự chuyển hồ sơ cho cơ quan thuế | Thời gian cơ quan tố tụng hình sự thụ lý hồ sơ được xem xét tính vào thời hiệu xử phạt hành chính. |
Căn cứ: Điều 8 Nghị định 125/2020/NĐ-CP.
Quy định xử phạt vi phạm thuế và chậm nộp thuế
| Hành vi | Mức phạt | Ghi chú |
| Khai sai, khai thiếu phải nộp, tăng số thuế được hoàn | 20% số thuế khai sai, khai thiếu hoặc số tiền được hoàn | Không bị xem là trốn thuế, gian lận thuế |
| Trốn thuế, gian lận thuế | Ít nhất 01 lần số tiền thuế trốn gian lận; Tối đa 03 lần số tiền thuế trốn thuế, gian lận | Tùy thuộc vào số lần vi phạm và tình tiết tăng nặng, giảm nhẹ |
Căn cứ: Điều 17 Nghị định 125/2020/NĐ-CP
Trường hợp phát sinh lãi chậm nộp:
| Thời điểm | Mức lãi chậm nộp |
| Trước 01/7/2013 | 0,05%/ngày |
| Từ 01/01/2013 – 01/01/2015 |
|
| Từ sau 01/5/2015 – 01/7/2016 | 0,05%/ngày |
| Từ 01/7/2016 trở đi | 0,03%/ngày |
Căn cứ: Luật Quản lý thuế 2006, Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Quản lý thuế 2014 và Luật Quản lý thuế 2019.
Kết luận: Chủ động chuẩn bị để vượt qua thanh tra thuế an toàn, minh bạch
Thanh tra, kiểm tra thuế là một phần tất yếu trong quá trình hoạt động của doanh nghiệp. Thay vì lo lắng hoặc bị động, doanh nghiệp cần chủ động rà soát toàn bộ hệ thống sổ sách kế toán, hồ sơ pháp lý và dữ liệu thuế, đảm bảo sự nhất quán, đầy đủ và minh bạch theo đúng quy định hiện hành.
Kinh nghiệm thực tiễn cho thấy, các công ty được chuẩn bị kỹ lưỡng trước thanh tra thường hạn chế tối đa rủi ro bị truy thu thuế, phạt chậm nộp hay ảnh hưởng đến uy tín thương hiệu. Ngược lại, nếu thiếu kế toán chuyên sâu hoặc áp dụng sai quy định thuế, doanh nghiệp dễ gặp tổn thất lớn không chỉ về tài chính mà còn về pháp lý.
Khuyến nghị từ chuyên gia:
Tối thiểu mỗi năm một lần, doanh nghiệp nên kiểm tra lại toàn bộ hồ sơ thuế và báo cáo tài chính.
Ưu tiên thuê kiểm toán độc lập uy tín giá rẻ hoặc tư vấn thuế chuyên nghiệp trước kỳ thanh tra.
Lưu trữ chứng từ, hợp đồng và biên bản đầy đủ, dễ tra cứu, phân loại theo năm/tháng.
Cập nhật liên tục các quy định mới nhất về thuế, hóa đơn, xử phạt hành chính để không áp dụng sai.
👉 Nếu bạn cần hỗ trợ chuẩn bị hồ sơ quyết toán thuế, dịch vụ kiểm toán thuế hoặc soát xét sổ sách trước khi thanh tra, hãy liên hệ ngay với đội ngũ kiểm toán viên hành nghề tại dichvukiemtoanbctc.com – hơn 15 năm đồng hành cùng hàng ngàn doanh nghiệp trên toàn quốc vượt qua thanh tra thuế hiệu quả, tiết kiệm và minh bạch.
Báo chí nói về thương hiệu kiểm toán chúng tôi:
- Báo lớn cafebiz nói về dịch vụ kiểm toán thuế dichvukiemtoanbctc.com uy tín.
- Báo 24h.com.vn nói lợi ích và vai trò của dịch vụ kiểm toán cty lớn dichvukiemtoanbctc.com hàng đầu.
- Báo Pháp Luật, cùng chuyên gia kiểm toán thương hiệu dichvukiemtoanbctc.com tìm hiểu: Các ý kiến kiểm toán.
- Báo uy tín hàng đầu của tp Đà Nẵng (baodanang.vn) chia sẻ: Thương hiệu Dichvukiemtoanbctc.com giải pháp hoàn hảo cho doanh nghiệp về dịch vụ kế toán kiểm toán.
- Báo tỉnh Quảng Ngãi – baoquangngai.vn nói về dịch vụ kiểm toán cuối năm.
Những câu hỏi thường gặp
1. Có bắt buộc phải nộp lại tờ khai thuế nếu phát hiện sai sót trước thanh tra không?
TRẢ LỜI: Không bắt buộc, nhưng nếu doanh nghiệp phát hiện sai sót và kịp thời điều chỉnh trước khi đoàn thanh tra thuế công bố quyết định, thì sẽ giảm thiểu rủi ro bị xử phạt. Việc tự khai bổ sung và nộp lại tờ khai là dấu hiệu tích cực, thể hiện tính chủ động và thiện chí tuân thủ pháp luật thuế.
2. Bao lâu sau khi nhận quyết định thanh tra thì cơ quan thuế sẽ làm việc?
TRẢ LỜI: Thông thường, sau khi ban hành quyết định thanh tra, cơ quan thuế công bố quyết định trong vòng 10 ngày và tiến hành làm việc tại doanh nghiệp ngay sau đó. Tuy nhiên, doanh nghiệp có thể gửi công văn xin lùi lịch làm việc nếu cần thêm thời gian chuẩn bị.
3. Khi thanh tra thuế có cần phải nộp bản in sổ sách hay chỉ cần file mềm?
TRẢ LỜI: Tùy theo yêu cầu của đoàn thanh tra. Tuy nhiên, theo kinh nghiệm thực tiễn, kế toán nên in đầy đủ sổ sách kế toán, bảng kê thuế, hóa đơn chứng từ để phục vụ quá trình đối chiếu tại chỗ. Điều này giúp quá trình thanh tra diễn ra nhanh chóng, minh bạch và ít phát sinh rắc rối.
4. Kế toán cũ nghỉ việc, không bàn giao đủ chứng từ thì thanh tra thuế có bị phạt không?
TRẢ LỜI: Nếu chứng từ không đầy đủ và không chứng minh được tính hợp lý – hợp lệ của chi phí hoặc doanh thu, doanh nghiệp có thể bị loại trừ chi phí khi tính thuế, dẫn đến truy thu và phạt hành chính. Trường hợp này, nên nhờ đơn vị kiểm toán – kế toán chuyên nghiệp hỗ trợ rà soát và khắc phục hồ sơ thiếu sót.
5. Có nên ghi ý kiến bảo lưu nếu không đồng ý với biên bản thanh tra thuế?
TRẢ LỜI: Có. Nếu doanh nghiệp cảm thấy nội dung trong biên bản chưa phản ánh đúng thực tế, có quyền ghi ý kiến bảo lưu vào biên bản làm việc. Đồng thời, có thể nộp đơn khiếu nại trong vòng 90 ngày kể từ ngày nhận biên bản hoặc quyết định xử lý của cơ quan thuế.
GỌI NGAY ĐỂ TƯ VẤN CHI TIẾT và BÁO GIÁ, Hotline: 098 225 4812- Mr. Các.
WEB: https://dichvukiemtoanbctc.com/
Facebook: https://www.facebook.com/Congtykiemtoandoclapuytin/